PoplarV1, Main, Exploration, bibRecord, 001C31

Multilocus analysis of nucleotide variation and speciation in three closely related Populus (Salicaceae) species.

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Multilocus analysis of nucleotide variation and speciation in three closely related Populus (Salicaceae) species.

Auteurs : Shuhui Du [République populaire de Chine] ; Zhaoshan Wang [République populaire de Chine] ; P R K. Ingvarsson [Suède] ; Dongsheng Wang [République populaire de Chine] ; Junhui Wang [République populaire de Chine] ; Zhiqiang Wu [États-Unis] ; Luke R. Tembrock [États-Unis] ; Jianguo Zhang [République populaire de Chine]

Source :

Molecular ecology [ 1365-294X ] ; 2015.

RBID : pubmed:26334549

Descripteurs français

English descriptors

KwdEn :
- DNA, Chloroplast (genetics), DNA, Plant (genetics), Genetic Markers (MeSH), Genetic Speciation (MeSH), Genetic Variation (MeSH), Genetics, Population (MeSH), Haplotypes (MeSH), Models, Genetic (MeSH), Molecular Sequence Data (MeSH), Phylogeny (MeSH), Populus (classification), Populus (genetics), Sequence Analysis, DNA (MeSH).
MESH :
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- classification : Populus.
- genetics : Populus.
- Genetic Speciation, Genetic Variation, Genetics, Population, Haplotypes, Models, Genetic, Molecular Sequence Data, Phylogeny, Sequence Analysis, DNA.

Abstract

Historical tectonism and climate oscillations can isolate and contract the geographical distributions of many plant species, and they are even known to trigger species divergence and ultimately speciation. Here, we estimated the nucleotide variation and speciation in three closely related Populus species, Populus tremuloides, P. tremula and P. davidiana, distributed in North America and Eurasia. We analysed the sequence variation in six single-copy nuclear loci and three chloroplast (cpDNA) fragments in 497 individuals sampled from 33 populations of these three species across their geographic distributions. These three Populus species harboured relatively high levels of nucleotide diversity and showed high levels of nucleotide differentiation. Phylogenetic analysis revealed that P. tremuloides diverged earlier than the other two species. The cpDNA haplotype network result clearly illustrated the dispersal route from North America to eastern Asia and then into Europe. Molecular dating results confirmed that the divergence of these three species coincided with the sundering of the Bering land bridge in the late Miocene and a rapid uplift of the Qinghai-Tibetan Plateau around the Miocene/Pliocene boundary. Vicariance-driven successful allopatric speciation resulting from historical tectonism and climate oscillations most likely played roles in the formation of the disjunct distributions and divergence of these three Populus species.

DOI: 10.1111/mec.13368
PubMed: 26334549

Affiliations:

République populaire de Chine, Suède, États-Unis

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<Abstract><AbstractText>Historical tectonism and climate oscillations can isolate and contract the geographical distributions of many plant species, and they are even known to trigger species divergence and ultimately speciation. Here, we estimated the nucleotide variation and speciation in three closely related Populus species, Populus tremuloides, P. tremula and P. davidiana, distributed in North America and Eurasia. We analysed the sequence variation in six single-copy nuclear loci and three chloroplast (cpDNA) fragments in 497 individuals sampled from 33 populations of these three species across their geographic distributions. These three Populus species harboured relatively high levels of nucleotide diversity and showed high levels of nucleotide differentiation. Phylogenetic analysis revealed that P. tremuloides diverged earlier than the other two species. The cpDNA haplotype network result clearly illustrated the dispersal route from North America to eastern Asia and then into Europe. Molecular dating results confirmed that the divergence of these three species coincided with the sundering of the Bering land bridge in the late Miocene and a rapid uplift of the Qinghai-Tibetan Plateau around the Miocene/Pliocene boundary. Vicariance-driven successful allopatric speciation resulting from historical tectonism and climate oscillations most likely played roles in the formation of the disjunct distributions and divergence of these three Populus species. </AbstractText>
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Multilocus analysis of nucleotide variation and speciation in three closely related Populus (Salicaceae) species.

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